马德里商标注册的优点包括：

1. 商标注册手续相对简单，只需要填写一份申请表格并缴纳一次费用即可。
2. 商标注册申请时间较短，一般在递交申请后3-4个月左右就可以获得国际注册证明。
3. 商标注册费用较低，比单一国家注册要便宜很多，而且后续的变更、转让、续展等申请也只需要提交一份申请并缴纳一次费用。
4. 商标注册覆盖地域较广，可以在多个国家或地区获得保护。

马德里商标注册的缺点包括：

1. 需要以在原属国已申请或已注册的商标为基础商标才能申请。
2. 对商标的保护期限是从国际注册日起算，而不是从原属国注册日起算。
3. 如果原属国的商标被撤销或无效，则国际注册也会被撤销或无效。

单一国家注册的优点包括：

1. 可以直接向各国商标局递交申请，无需通过第三方机构。
2. 对商标的保护期限是从申请日起算，而不是从国际注册日起算。
3. 如果某个国家的商标被撤销或无效，不会影响在其他国家的保护。

单一国家注册的缺点包括：

1. 商标注册手续比较繁琐，需要在每个国家都进行申请和审查。
2. 商标注册费用较高，需要支付每个国家的申请费用和审查费用。
3. 商标注册覆盖地域较窄，只能在申请的国家获得保护。

综上所述，马德里商标注册和单一国家注册各有优缺点，需要根据具体情况和需求进行选择。如果希望在多个国家获得保护并且降低成本和简化流程，那么马德里商标注册可能更适合；如果需要在特定国家获得更强的保护并且有足够的预算和处理能力，那么单一国家注册可能更适合。